По-конкретно въпроса ми е за следната ситуация:
ЕТ съм, формирам данъчната си основа по ЗКПО, следва ли да внасям 20% върху брутния размер на дохода, след като на края на отчетния период дохода ми се облага по чл. 35 ал.1 и си правя тримесечни авансови вноски по ЗКПО / тъй като миналата година съм бил на патент/?
Ако не следва, този член кога се прилага?

Може би ви обърква именно това, че до миналата година сте били на патент и не сте се интересували от облагаемата си печалба.
Член 40 от ЗОДФЛ въобще не се отнася за облагане доходите на ЕТ!
Този член се прилага във връзка с чл.26, т.2-8 и 10 - за доходи от парични и предметни награди от състезания и конкурси, обезщетения за пропуснати ползи, права на интелектуална собственост по наследство, случайни сделки. Ако имате такива доходи /извън доходите от ЕТ/, тогава платеца на тези доходи ще ви удържи окончателен данък от 20%. Само в тези случаи се прилага чл.40.
Лека работа!
Александрова